Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm26074-201ENSMUST00000104063 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Rhox11-ps3-201ENSMUST00000121166 233 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm24691-201ENSMUST00000157762 140 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Olfr1319-ps1-201ENSMUST00000208550 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm25878-201ENSMUST00000104327 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm14671-201ENSMUST00000121790 262 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm25280-201ENSMUST00000157269 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm24747-201ENSMUST00000157835 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm22387-201ENSMUST00000158191 131 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm24705-201ENSMUST00000082808 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm25697-201ENSMUST00000082902 98 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm44325-201ENSMUST00000196757 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm44464-201ENSMUST00000198010 138 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Cdh4-202ENSMUST00000098996 69 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SrrtQ99MR6 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm26011-201ENSMUST00000104410 104 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm20477-201ENSMUST00000174028 280 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm25588-201ENSMUST00000082501 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm43602-201ENSMUST00000196772 300 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm24410-201ENSMUST00000083433 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Olfr1161-203ENSMUST00000217006 3647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 AC129202.1-201ENSMUST00000224895 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Mir489-201ENSMUST00000093599 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm14502-201ENSMUST00000118154 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm23504-201ENSMUST00000158988 95 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm26084-201ENSMUST00000157903 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Gm25771-201ENSMUST00000158565 144 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SrrtQ99MR6 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms