Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Mir218-1-201ENSMUST00000083669 110 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm27544-201ENSMUST00000185069 155 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm18795-201ENSMUST00000222371 3266 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Mir3961-201ENSMUST00000198795 59 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 AC168056.1-201ENSMUST00000225270 180 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm13219-201ENSMUST00000144870 3019 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Mir7226-201ENSMUST00000184953 60 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm44057-201ENSMUST00000204547 96 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm33962-201ENSMUST00000182643 2592 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm44680-201ENSMUST00000208414 2910 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Olfr1291-ps1-201ENSMUST00000121345 5403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gpr174-202ENSMUST00000117310 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm37116-201ENSMUST00000195161 147 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm44028-201ENSMUST00000205205 355 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 AC144671.1-201ENSMUST00000215265 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 AC127371.3-201ENSMUST00000228129 415 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23337-201ENSMUST00000158959 118 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm44921-201ENSMUST00000205290 301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 AL627387.1-201ENSMUST00000226063 250 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm10813-201ENSMUST00000099936 90 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm22727-201ENSMUST00000158090 116 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm29603-201ENSMUST00000186792 334 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Mir301-201ENSMUST00000083655 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23947-201ENSMUST00000093636 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Agmo-201ENSMUST00000049874 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23950-201ENSMUST00000104026 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23390-201ENSMUST00000157393 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Traj20-201ENSMUST00000103721 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 Snord100-201ENSMUST00000116836 74 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Apobec3Q99J72 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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