Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25831-201ENSMUST00000158924 163 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm27585-201ENSMUST00000183717 199 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24902-201ENSMUST00000158126 123 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24415-201ENSMUST00000180218 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Vmn2r69-201ENSMUST00000171213 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm22665-201ENSMUST00000158720 275 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir384-201ENSMUST00000083565 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Zfp960-201ENSMUST00000127027 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24121-201ENSMUST00000102029 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm23545-201ENSMUST00000158205 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25015-201ENSMUST00000158400 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Olfr1366-201ENSMUST00000168629 1054 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm2077-201ENSMUST00000195017 319 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm20005-201ENSMUST00000202583 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Olfr1366-204ENSMUST00000218154 1054 ntAPPRIS P2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm22767-201ENSMUST00000158365 165 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24366-201ENSMUST00000175383 86 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm27511-201ENSMUST00000183502 127 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Zfp600-201ENSMUST00000092750 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
Trim71Q1PSW8 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm23766-201ENSMUST00000103894 80 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 1700016B01Rik-201ENSMUST00000197688 270 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm44177-201ENSMUST00000204338 2667 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm24229-201ENSMUST00000158830 118 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm35309-201ENSMUST00000208337 478 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Mir466p-201ENSMUST00000103925 89 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm24867-201ENSMUST00000104161 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm25565-201ENSMUST00000104605 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Snord19-201ENSMUST00000104609 76 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm12068-201ENSMUST00000153153 376 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm23170-201ENSMUST00000157158 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
Trim71Q1PSW8 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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