Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm14086-201ENSMUST00000117152 173 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm16355-201ENSMUST00000128606 231 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm25056-201ENSMUST00000157372 62 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr1258-203ENSMUST00000213720 7098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Mrgprx2-201ENSMUST00000098433 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gp6-202ENSMUST00000206928 5900 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Vmn1r173-202ENSMUST00000226233 9416 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm12185-202ENSMUST00000094476 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm22965-201ENSMUST00000157958 101 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm45317-201ENSMUST00000210385 223 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Dnah2-202ENSMUST00000108659 13704 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr64-201ENSMUST00000081748 5001 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Slc7a2-203ENSMUST00000117077 7626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Map9-206ENSMUST00000195640 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm38295-201ENSMUST00000191951 151 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Hmcn1-202ENSMUST00000137197 16554 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm37625-201ENSMUST00000194969 4872 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Ccr9-205ENSMUST00000180093 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Mir6996-201ENSMUST00000183922 61 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm8069-201ENSMUST00000197887 154 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr1312-203ENSMUST00000213961 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Spef2-206ENSMUST00000208854 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr912-201ENSMUST00000217160 5726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm23951-201ENSMUST00000104029 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm25949-201ENSMUST00000175333 114 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Wnk3-206ENSMUST00000184730 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm24788-201ENSMUST00000104283 156 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 H2al1n-201ENSMUST00000105137 514 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Kcne1-202ENSMUST00000166707 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Gm45804-201ENSMUST00000212137 3435 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
Hoxd11P23813 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Stxbp4-207ENSMUST00000143203 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Zbtb20-204ENSMUST00000114694 26901 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm22889-201ENSMUST00000158639 58 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm23215-201ENSMUST00000178153 121 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm27977-201ENSMUST00000185159 111 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Macf1-204ENSMUST00000106213 18957 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Cybb-201ENSMUST00000015484 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm45223-201ENSMUST00000207037 5138 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Dync2h1-201ENSMUST00000048417 13972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Cnot1-201ENSMUST00000068452 8152 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm22544-201ENSMUST00000104349 127 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Kctd4-201ENSMUST00000050120 3998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm37626-201ENSMUST00000194332 4563 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Fat2-201ENSMUST00000068853 14528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Cntnap5b-201ENSMUST00000086738 4027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Hoxd11P23813 Gm18609-201ENSMUST00000203370 3601 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.1 ms