Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm25882-201ENSMUST00000157784 85 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm10421-202ENSMUST00000186114 132 ntTSL 3 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir7229-201ENSMUST00000197062 53 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm44455-201ENSMUST00000200061 82 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 AC122769.2-201ENSMUST00000227248 302 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Snord82-201ENSMUST00000082889 70 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22368-201ENSMUST00000102416 109 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm11904-201ENSMUST00000120562 248 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23212-201ENSMUST00000122718 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm28001-201ENSMUST00000183561 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir8107-201ENSMUST00000184024 117 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm13059-201ENSMUST00000119881 398 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24345-201ENSMUST00000158706 124 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm17172-201ENSMUST00000171782 190 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir7039-201ENSMUST00000183852 85 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm25496-201ENSMUST00000104430 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir3089-201ENSMUST00000175350 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm26073-201ENSMUST00000179906 127 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir8116-201ENSMUST00000184134 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir451a-201ENSMUST00000093557 72 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24575-201ENSMUST00000175502 77 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir3967-201ENSMUST00000198710 68 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm24256-201ENSMUST00000083696 84 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Vmn1r-ps125-201ENSMUST00000117767 290 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
Prrt1O35449 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.9 ms