Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC0.13□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24555-201ENSMUST00000104548 124 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.11□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24772-201ENSMUST00000158507 110 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Rpl23a-ps7-201ENSMUST00000185437 460 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
Ccdc171E9Q1U1 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm14400-201ENSMUST00000117234 2135 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.08□□□□□ -2.4
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Ccdc171E9Q1U1 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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Ccdc171E9Q1U1 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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Ccdc171E9Q1U1 Gm22239-201ENSMUST00000175220 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
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Ccdc171E9Q1U1 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25375-201ENSMUST00000158157 135 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm44811-201ENSMUST00000209120 228 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm45471-201ENSMUST00000211270 281 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm23921-201ENSMUST00000175258 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Mir6896-201ENSMUST00000198033 73 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm19572-201ENSMUST00000214326 338 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm25703-201ENSMUST00000083123 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Ccdc171E9Q1U1 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
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