Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir465b-1-201ENSMUST00000103940 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir465b-2-201ENSMUST00000104662 79 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24833-201ENSMUST00000116775 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Obox4-ps37-201ENSMUST00000177223 276 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir30c-2-201ENSMUST00000083633 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24381-201ENSMUST00000122697 104 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23232-201ENSMUST00000157300 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24903-201ENSMUST00000158131 126 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44345-201ENSMUST00000199560 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24042-201ENSMUST00000083114 103 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23584-201ENSMUST00000157655 129 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42857-201ENSMUST00000200823 339 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr797-ps1-201ENSMUST00000203614 415 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21897-201ENSMUST00000178312 1500 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ighv1-47-201ENSMUST00000103518 294 ntAPPRIS P1 BASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15289-201ENSMUST00000117793 244 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarna3a-201ENSMUST00000158911 140 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1933-201ENSMUST00000158930 88 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25952-201ENSMUST00000175329 74 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22801-201ENSMUST00000175624 84 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44063-201ENSMUST00000203307 376 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930598N05Rik-207ENSMUST00000208997 83 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45508-201ENSMUST00000209298 299 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24527-201ENSMUST00000082920 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s73-201ENSMUST00000122508 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24000-201ENSMUST00000158063 89 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23838-201ENSMUST00000158067 162 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25558-201ENSMUST00000158083 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 174.6 ms