Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 Gm24634-201ENSMUST00000158672 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Irx4Q9QY61 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm25812-201ENSMUST00000082751 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22264-201ENSMUST00000178200 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir6350-201ENSMUST00000183639 105 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Ptp4a1-206ENSMUST00000202889 135 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Zfp616-205ENSMUST00000178159 2964 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22373-201ENSMUST00000104584 89 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm25920-201ENSMUST00000158307 99 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm24375-201ENSMUST00000104397 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm22297-201ENSMUST00000083312 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Irx4Q9QY61 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm22517-201ENSMUST00000158265 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm24049-201ENSMUST00000102409 100 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Irx4Q9QY61 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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