Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 AC158598.2-201ENSMUST00000213397 3832 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm25783-201ENSMUST00000122525 190 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm22598-201ENSMUST00000157600 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm25450-201ENSMUST00000179144 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Mir19b-2-201ENSMUST00000083539 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc47Q9D024 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Traj13-201ENSMUST00000103728 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm13518-201ENSMUST00000120018 233 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 n-R5s70-201ENSMUST00000122650 116 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm28489-201ENSMUST00000186655 316 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 AC124182.1-201ENSMUST00000227091 321 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm42606-201ENSMUST00000114209 239 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm16265-201ENSMUST00000134558 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir6540-201ENSMUST00000184886 108 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir468-201ENSMUST00000197332 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir324-201ENSMUST00000083600 89 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm36956-201ENSMUST00000193830 214 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm44149-201ENSMUST00000204256 226 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.68□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir654-201ENSMUST00000104787 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm23113-201ENSMUST00000158477 99 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm24678-201ENSMUST00000158756 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm20923-201ENSMUST00000190009 319 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm21088-201ENSMUST00000190875 316 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Olfr865-ps1-201ENSMUST00000212071 85 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 AC098718.2-201ENSMUST00000226822 285 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir410-201ENSMUST00000083563 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm25982-201ENSMUST00000157920 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm24498-201ENSMUST00000158445 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Mir1961-201ENSMUST00000158643 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm22914-201ENSMUST00000175195 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm28435-201ENSMUST00000185496 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 AC116589.4-201ENSMUST00000222390 216 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc47Q9D024 Gm22796-201ENSMUST00000157234 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc47Q9D024 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc47Q9D024 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc47Q9D024 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc47Q9D024 CT025603.4-201ENSMUST00000225777 413 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc47Q9D024 Gm22809-201ENSMUST00000082743 156 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc47Q9D024 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc47Q9D024 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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