Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF1

Bco2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco2Q99NF1 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23289-201ENSMUST00000175615 108 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Olfr868-201ENSMUST00000212767 4196 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Olfr1029-202ENSMUST00000217244 3743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm3724-201ENSMUST00000197957 349 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm22866-201ENSMUST00000083947 177 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23060-201ENSMUST00000102345 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm9251-201ENSMUST00000197202 628 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Mir429-201ENSMUST00000083493 83 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Zfp966-201ENSMUST00000108949 2939 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Mir7225-201ENSMUST00000184178 54 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm45654-201ENSMUST00000210980 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Mir93-201ENSMUST00000083593 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 Mir300-201ENSMUST00000083485 79 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Bco2Q99NF1 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Bco2Q99NF1 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.3 ms