Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm13976-201ENSMUST00000154367 479 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm23548-201ENSMUST00000158963 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm27878-201ENSMUST00000184000 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Mir222-201ENSMUST00000083537 79 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Olfr1098-202ENSMUST00000111574 2885 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Rnu7-201ENSMUST00000158458 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 AC168880.2-201ENSMUST00000224488 201 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm24676-201ENSMUST00000158758 75 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm17490-201ENSMUST00000166779 63 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm22510-201ENSMUST00000179304 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm26336-201ENSMUST00000179449 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm23966-201ENSMUST00000179823 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 AC134601.1-201ENSMUST00000221058 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Ighv15-1-201ENSMUST00000194450 276 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 AC129085.5-201ENSMUST00000225468 400 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Olfr1153-202ENSMUST00000217436 2144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Olfr1208-202ENSMUST00000214121 2823 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Vmn2r70-201ENSMUST00000168230 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Olfr777-202ENSMUST00000204573 5407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm27851-201ENSMUST00000183529 63 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm24536-201ENSMUST00000083144 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm25371-201ENSMUST00000158162 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Gm26624-201ENSMUST00000181486 3769 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Apobec3Q99J72 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 n-R5s159-201ENSMUST00000122681 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm24167-201ENSMUST00000177733 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm24028-201ENSMUST00000178991 124 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm9156-201ENSMUST00000189660 463 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm24098-201ENSMUST00000102075 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm25381-201ENSMUST00000102078 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm11250-201ENSMUST00000142137 306 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Apobec3Q99J72 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.1 ms