Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm27421-201ENSMUST00000184729 167 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm14937-201ENSMUST00000119709 208 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm24668-201ENSMUST00000158935 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 4930598A11Rik-201ENSMUST00000180742 628 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm27517-201ENSMUST00000184347 236 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm23370-201ENSMUST00000199545 130 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm44563-201ENSMUST00000207958 178 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Traj52-201ENSMUST00000103691 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm23101-201ENSMUST00000157550 137 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm17215-201ENSMUST00000170074 277 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm28794-201ENSMUST00000185276 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Mir466e-201ENSMUST00000198862 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Mir466c-1-201ENSMUST00000200654 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Slco6c1-201ENSMUST00000027569 2747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Mir293-201ENSMUST00000104841 80 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm23841-201ENSMUST00000116951 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm23656-201ENSMUST00000122626 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm23267-201ENSMUST00000178490 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 AC157476.1-201ENSMUST00000215555 169 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 CU062626.2-201ENSMUST00000223953 274 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm16225-201ENSMUST00000146152 276 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Mir3057-201ENSMUST00000175040 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm27493-201ENSMUST00000184128 78 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Mir6419-201ENSMUST00000184784 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Cdh18E9Q9Q6 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm16976-205ENSMUST00000227324 226 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm26468-201ENSMUST00000158644 106 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Mir7241-201ENSMUST00000184532 64 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Traj26-201ENSMUST00000103715 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23208-201ENSMUST00000158666 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23967-201ENSMUST00000175062 78 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23571-201ENSMUST00000180073 127 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm27265-201ENSMUST00000183559 77 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1222-203ENSMUST00000215816 3796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm23836-201ENSMUST00000104434 129 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Cdh18E9Q9Q6 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 225.8 ms