Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29014-201ENSMUST00000191422 326 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44948-201ENSMUST00000209050 149 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir32-201ENSMUST00000083610 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15327-202ENSMUST00000153958 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22447-201ENSMUST00000158155 92 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22888-201ENSMUST00000158640 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44488-201ENSMUST00000199467 119 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm30155-201ENSMUST00000223458 339 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.12□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Traj35-201ENSMUST00000103706 65 ntAPPRIS P1 BASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir880-201ENSMUST00000104809 78 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25825-201ENSMUST00000157091 124 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22983-201ENSMUST00000158308 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22200-201ENSMUST00000158614 67 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45092-201ENSMUST00000205944 545 ntTSL 3 BASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22786-201ENSMUST00000104086 122 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23749-201ENSMUST00000104223 131 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25109-201ENSMUST00000122474 114 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28256-201ENSMUST00000188953 139 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28559-201ENSMUST00000190532 139 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23036-201ENSMUST00000157885 99 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27475-201ENSMUST00000183420 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir7065-201ENSMUST00000185110 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.09□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir709-201ENSMUST00000102190 88 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6365-201ENSMUST00000183990 101 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25855-201ENSMUST00000082787 72 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scarna8-201ENSMUST00000158333 131 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22435-201ENSMUST00000158552 128 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir1931-201ENSMUST00000158589 119 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24818-201ENSMUST00000175093 161 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11392-201ENSMUST00000181419 710 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45119-201ENSMUST00000207612 199 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45541-201ENSMUST00000210443 54 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 184.3 ms