Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm24585-201ENSMUST00000178104 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22627-201ENSMUST00000178127 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22912-201ENSMUST00000178242 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24866-201ENSMUST00000178338 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22524-201ENSMUST00000178357 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25710-201ENSMUST00000178367 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm23575-201ENSMUST00000178406 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24872-201ENSMUST00000178434 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22449-201ENSMUST00000178924 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24702-201ENSMUST00000178965 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24206-201ENSMUST00000179011 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24528-201ENSMUST00000179164 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22909-201ENSMUST00000179190 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm26334-201ENSMUST00000179403 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25463-201ENSMUST00000179405 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25742-201ENSMUST00000179530 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25209-201ENSMUST00000179576 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm26392-201ENSMUST00000179661 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25230-201ENSMUST00000179740 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm26434-201ENSMUST00000179778 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25741-201ENSMUST00000179825 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24759-201ENSMUST00000179827 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24219-201ENSMUST00000179861 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Trav7-6-202ENSMUST00000184687 275 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm23254-201ENSMUST00000097244 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25270-201ENSMUST00000122606 138 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24650-201ENSMUST00000157105 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22946-201ENSMUST00000158558 82 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm18665-201ENSMUST00000189783 270 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm38364-201ENSMUST00000191814 179 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 CT025538.3-201ENSMUST00000225279 3848 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm26091-201ENSMUST00000122704 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm23268-201ENSMUST00000175494 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm44326-201ENSMUST00000198226 101 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 AC117199.1-201ENSMUST00000219940 3132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25500-201ENSMUST00000104426 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm27668-201ENSMUST00000184188 120 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm44976-201ENSMUST00000205543 261 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm42719-201ENSMUST00000197393 355 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm8219-201ENSMUST00000218309 242 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 AC147101.2-201ENSMUST00000219756 184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Mir201-201ENSMUST00000083470 66 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
RpainQ9CWY9 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.2 ms