Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24900-201ENSMUST00000158128 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm13560-201ENSMUST00000121865 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm43373-201ENSMUST00000202552 2870 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 AC122828.3-201ENSMUST00000223019 3915 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 AC159625.1-201ENSMUST00000220994 2625 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm12941-201ENSMUST00000117934 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm22699-201ENSMUST00000175376 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm23665-201ENSMUST00000158054 62 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm25464-201ENSMUST00000175481 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 AC153646.2-201ENSMUST00000220516 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm6952-201ENSMUST00000118629 159 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm22227-201ENSMUST00000157356 259 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm22535-201ENSMUST00000158174 119 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm23342-201ENSMUST00000158958 115 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Mir6901-201ENSMUST00000185062 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Mir6376-201ENSMUST00000185149 131 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Zfp788-207ENSMUST00000170770 2499 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm26345-201ENSMUST00000157534 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm28912-201ENSMUST00000189001 234 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Apobec3Q99J72 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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