Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Olfr1186-202ENSMUST00000215912 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm14914-201ENSMUST00000117576 2031 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm22221-201ENSMUST00000157362 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Snord89-201ENSMUST00000104516 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm24390-201ENSMUST00000179578 62 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 AC154282.1-201ENSMUST00000223154 265 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Gm44133-202ENSMUST00000204450 2586 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
Apobec3Q99J72 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 n-R5s191-201ENSMUST00000122724 116 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm25716-201ENSMUST00000158628 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm45652-201ENSMUST00000210926 3831 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24615-201ENSMUST00000083268 113 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24276-201ENSMUST00000102181 110 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Mir374b-201ENSMUST00000102314 95 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm25945-201ENSMUST00000122484 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 2210418O10Rik-202ENSMUST00000135430 195 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 AC154994.1-201ENSMUST00000217395 302 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Olfr1450-203ENSMUST00000213925 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm21940-201ENSMUST00000204940 2278 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps120-201ENSMUST00000120288 377 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24595-201ENSMUST00000122501 110 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm25267-201ENSMUST00000158522 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm22476-201ENSMUST00000158902 100 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Rgs18-201ENSMUST00000027603 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Igkv14-118-1-201ENSMUST00000198645 334 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 AC150901.1-201ENSMUST00000208407 145 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 AC126672.1-201ENSMUST00000217096 396 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 AC192091.2-201ENSMUST00000217869 117 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm10217-201ENSMUST00000088080 135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Apobec3Q99J72 Gm22486-201ENSMUST00000116815 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 152.4 ms