Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm44375-201ENSMUST00000196657 150 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm45027-201ENSMUST00000207081 78 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 CT030170.3-201ENSMUST00000221205 1815 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22149-201ENSMUST00000104442 136 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm26149-201ENSMUST00000157432 108 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm23898-201ENSMUST00000158111 103 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm24880-201ENSMUST00000158776 85 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm20409-201ENSMUST00000173457 130 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm25136-201ENSMUST00000083253 115 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Scgb1b23-ps-201ENSMUST00000116009 252 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm14947-201ENSMUST00000133704 303 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Ranbp2-ps6-201ENSMUST00000183722 381 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm44602-201ENSMUST00000205948 132 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22303-201ENSMUST00000082686 122 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22340-201ENSMUST00000157717 114 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm23151-201ENSMUST00000178061 107 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Mir7038-201ENSMUST00000184833 71 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 1810007C17Rik-201ENSMUST00000187665 710 ntTSL 1 (best) BASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22738-201ENSMUST00000083440 147 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm24254-201ENSMUST00000083702 104 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22586-201ENSMUST00000157507 122 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22283-201ENSMUST00000082556 161 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
Gm21060J3KMU4 Gm24338-201ENSMUST00000104205 127 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm12771-201ENSMUST00000120246 135 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Ranbp2-ps5-201ENSMUST00000185141 379 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Trbv25-201ENSMUST00000194700 273 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm22981-201ENSMUST00000082611 75 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm25791-201ENSMUST00000083292 137 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Mir34a-201ENSMUST00000083559 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm25873-201ENSMUST00000180317 107 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Mir3065-201ENSMUST00000198674 87 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm25044-201ENSMUST00000158603 104 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm27715-201ENSMUST00000184714 260 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 n-R5s171-201ENSMUST00000104128 79 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 n-R5s12-201ENSMUST00000083785 119 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 n-R5s39-201ENSMUST00000122613 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 CT030684.2-201ENSMUST00000228946 826 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm16307-201ENSMUST00000161269 210 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Gm21060J3KMU4 Gm23159-201ENSMUST00000175088 77 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161.2 ms