Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Vmn2r72-201ENSMUST00000063425 2571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm14536-201ENSMUST00000118324 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm15067-201ENSMUST00000119534 156 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm15027-201ENSMUST00000120922 138 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25393-201ENSMUST00000157336 285 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25380-201ENSMUST00000175463 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24641-201ENSMUST00000178055 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25484-201ENSMUST00000178217 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm26138-201ENSMUST00000179236 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22821-201ENSMUST00000179288 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Mir7657-201ENSMUST00000196051 57 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC168266.1-201ENSMUST00000216024 226 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm23140-201ENSMUST00000082487 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm23298-201ENSMUST00000083181 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24614-201ENSMUST00000083269 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22057-201ENSMUST00000083387 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22154-201ENSMUST00000083844 131 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25516-201ENSMUST00000083857 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Mir450b-201ENSMUST00000102095 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm23772-201ENSMUST00000104433 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22105-201ENSMUST00000116734 116 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm23080-201ENSMUST00000157846 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Vmn2r65-201ENSMUST00000044583 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22141-201ENSMUST00000157403 277 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22612-201ENSMUST00000158293 101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25069-201ENSMUST00000175238 86 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25797-201ENSMUST00000082640 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22686-201ENSMUST00000082847 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Zfp638-212ENSMUST00000203891 3968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC152951.2-201ENSMUST00000218293 3587 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22845-201ENSMUST00000157712 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22070-201ENSMUST00000178475 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC153512.4-201ENSMUST00000217783 426 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr251-202ENSMUST00000214865 4930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24232-201ENSMUST00000104314 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24068-201ENSMUST00000104513 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25444-201ENSMUST00000158999 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25589-201ENSMUST00000082502 166 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Mir466-201ENSMUST00000093591 73 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
RpainQ9CWY9 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RpainQ9CWY9 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
RpainQ9CWY9 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
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