Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Gm26390-201ENSMUST00000179628 79 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Mir7009-201ENSMUST00000184519 64 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Gm42960-201ENSMUST00000202160 241 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1070-ps1-201ENSMUST00000215939 388 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 AC173482.4-201ENSMUST00000225096 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cdh18E9Q9Q6 Ppp4r3c-ps-201ENSMUST00000151416 2445 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s15-201ENSMUST00000122635 111 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm23982-201ENSMUST00000157141 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Ear-ps4-201ENSMUST00000166834 450 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm28724-201ENSMUST00000186149 625 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm44959-201ENSMUST00000209127 231 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm15611-201ENSMUST00000146928 406 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24909-201ENSMUST00000157290 280 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24076-201ENSMUST00000158179 94 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm23090-201ENSMUST00000177331 78 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr277-ps1-201ENSMUST00000205749 285 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm10092-201ENSMUST00000077110 180 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm43706-201ENSMUST00000198767 2652 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm19194-201ENSMUST00000192015 3774 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1172-ps1-201ENSMUST00000121530 192 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 n-R5s187-201ENSMUST00000122769 111 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm25362-201ENSMUST00000158854 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm5900-201ENSMUST00000179862 375 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Selenok-ps5-201ENSMUST00000221048 278 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 AC149294.9-201ENSMUST00000227256 164 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26495-201ENSMUST00000083152 137 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm23039-201ENSMUST00000083870 161 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26150-201ENSMUST00000157426 151 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26864-201ENSMUST00000181346 156 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm18433-201ENSMUST00000192747 197 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1151-202ENSMUST00000217376 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm21833-201ENSMUST00000177665 1500 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm14922-201ENSMUST00000121131 163 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm22118-201ENSMUST00000175593 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24966-201ENSMUST00000082443 79 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm43484-201ENSMUST00000198333 5966 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Vmn1r75-205ENSMUST00000228268 4376 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1228-203ENSMUST00000216392 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24079-201ENSMUST00000104352 132 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm24510-201ENSMUST00000174965 94 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Mir7683-201ENSMUST00000183842 61 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm44491-201ENSMUST00000196794 96 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 AC125020.2-201ENSMUST00000218894 348 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
Cdh18E9Q9Q6 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cdh18E9Q9Q6 Mir767-201ENSMUST00000103256 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cdh18E9Q9Q6 Mir669g-201ENSMUST00000116809 123 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cdh18E9Q9Q6 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Cdh18E9Q9Q6 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
Cdh18E9Q9Q6 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 395.6 ms