Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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Rnft1Q9DCN7 Gm24449-201ENSMUST00000083985 106 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Snora2b-201ENSMUST00000084005 137 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr830-202ENSMUST00000212723 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm23911-201ENSMUST00000104596 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm23194-201ENSMUST00000158813 105 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm44052-201ENSMUST00000203382 396 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm18346-201ENSMUST00000216782 325 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 AC183096.2-201ENSMUST00000228733 457 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
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Rnft1Q9DCN7 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
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Rnft1Q9DCN7 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
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Rnft1Q9DCN7 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Rnft1Q9DCN7 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Rnft1Q9DCN7 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Rnft1Q9DCN7 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Rnft1Q9DCN7 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
Rnft1Q9DCN7 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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