Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm23655-201ENSMUST00000122627 105 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir1951-201ENSMUST00000157981 89 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm23559-201ENSMUST00000157824 103 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir6917-201ENSMUST00000184111 61 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm28076-201ENSMUST00000188337 410 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Ifi209-201ENSMUST00000056071 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr652-204ENSMUST00000219111 5329 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm29613-201ENSMUST00000185846 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm29544-201ENSMUST00000188860 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm28808-201ENSMUST00000190978 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm22509-201ENSMUST00000082775 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mirlet7f-2-201ENSMUST00000083668 83 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm16186-201ENSMUST00000120132 216 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir5123-201ENSMUST00000177794 83 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm44114-201ENSMUST00000203270 2727 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm24878-201ENSMUST00000158782 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm26160-201ENSMUST00000158965 63 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm23303-201ENSMUST00000082714 152 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm24030-201ENSMUST00000083931 164 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr1370-204ENSMUST00000215806 4322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
RpainQ9CWY9 Gm44644-202ENSMUST00000208825 3133 ntTSL 2 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25625-201ENSMUST00000157221 96 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm22850-201ENSMUST00000157714 82 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm3333-201ENSMUST00000221637 452 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm15214-201ENSMUST00000122155 470 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm25060-201ENSMUST00000157374 130 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm28409-201ENSMUST00000187064 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
RpainQ9CWY9 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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