Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Mir1a-2-201ENSMUST00000198520 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm43046-201ENSMUST00000198771 2451 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm25888-201ENSMUST00000157778 302 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24001-201ENSMUST00000158463 85 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24106-201ENSMUST00000175498 127 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Rnu6-ps2-201ENSMUST00000178059 107 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm5002-201ENSMUST00000207145 223 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm13345-201ENSMUST00000121928 228 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm22989-201ENSMUST00000158313 86 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm25204-201ENSMUST00000082843 106 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm26126-201ENSMUST00000083188 164 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Adgrg4-204ENSMUST00000153784 9329 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm46993-201ENSMUST00000220708 259 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm23990-201ENSMUST00000117031 117 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24573-201ENSMUST00000175499 112 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps20-201ENSMUST00000179853 382 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm37146-201ENSMUST00000192572 463 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm37037-201ENSMUST00000194475 424 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm43676-201ENSMUST00000197532 540 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm40331-201ENSMUST00000198430 217 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 CT033785.1-201ENSMUST00000224872 272 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm25813-201ENSMUST00000082748 191 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm26493-201ENSMUST00000083155 136 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Mir127-201ENSMUST00000093568 70 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Rpl30-ps9-201ENSMUST00000122265 345 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm23963-201ENSMUST00000179603 77 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm26379-202ENSMUST00000200225 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 AC160863.1-201ENSMUST00000218412 317 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm25223-201ENSMUST00000158200 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm23182-201ENSMUST00000158688 135 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm44385-201ENSMUST00000198781 81 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Mir721-201ENSMUST00000200230 88 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Olfr1256-204ENSMUST00000215613 4543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Apobec3Q99J72 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
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