Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ttf1Q62187 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
Ttf1Q62187 Gm10033-201ENSMUST00000072427 1813 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
Ttf1Q62187 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm15391-201ENSMUST00000147509 257 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Cfap61-214ENSMUST00000167179 183 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm27898-201ENSMUST00000183987 80 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm23083-201ENSMUST00000157851 116 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm10717-205ENSMUST00000177601 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm27545-201ENSMUST00000184755 202 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm28344-201ENSMUST00000185704 279 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm28408-201ENSMUST00000191557 463 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 AC139186.1-201ENSMUST00000197610 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm23299-201ENSMUST00000082708 79 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Snord35a-201ENSMUST00000083884 90 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm25938-201ENSMUST00000104139 166 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Mir3098-201ENSMUST00000175416 87 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Mir7118-201ENSMUST00000197760 61 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Mir155-201ENSMUST00000083463 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 AC160115.1-201ENSMUST00000224678 1574 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm25011-201ENSMUST00000158398 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm43220-201ENSMUST00000199299 282 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm18360-201ENSMUST00000173327 1524 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Ttf1Q62187 Gm18291-201ENSMUST00000190791 301 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
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Ttf1Q62187 Gm25434-201ENSMUST00000158278 167 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm27419-201ENSMUST00000184576 109 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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Ttf1Q62187 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm25851-201ENSMUST00000082794 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm25166-201ENSMUST00000158909 111 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Mir6381-201ENSMUST00000183426 87 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm44387-201ENSMUST00000196298 145 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 CT025630.1-201ENSMUST00000227901 172 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm23627-201ENSMUST00000082459 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm22502-201ENSMUST00000082488 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm24149-201ENSMUST00000082757 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm22685-201ENSMUST00000082848 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Ttf1Q62187 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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