Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Snhg14-209ENSMUST00000188976 2193 ntTSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm28661-201ENSMUST00000188231 681 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC164612.2-202ENSMUST00000216314 253 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir33-201ENSMUST00000083531 69 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24271-201ENSMUST00000102327 111 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s188-201ENSMUST00000122646 105 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm26914-201ENSMUST00000182262 223 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir6394-201ENSMUST00000184738 99 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 CT009733.1-203ENSMUST00000224033 451 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22545-201ENSMUST00000104350 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm42506-201ENSMUST00000202009 150 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm43898-201ENSMUST00000204456 424 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 DQ267101-201ENSMUST00000082562 73 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr867-202ENSMUST00000212098 4228 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir701-201ENSMUST00000102208 109 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24385-201ENSMUST00000122694 350 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Defb44-ps-201ENSMUST00000126871 219 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 A130030D18Rik-201ENSMUST00000128608 654 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm44458-201ENSMUST00000196594 143 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir216a-201ENSMUST00000083605 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm13729-201ENSMUST00000120328 406 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23008-201ENSMUST00000158946 80 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir6364-201ENSMUST00000183396 86 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC163033.1-201ENSMUST00000218608 157 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 1700120G11Rik-201ENSMUST00000150273 491 ntTSL 1 (best) BASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm25750-201ENSMUST00000175483 112 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Mir6985-201ENSMUST00000184641 61 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm18213-201ENSMUST00000207850 178 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Snord33-201ENSMUST00000083694 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
Ccdc171E9Q1U1 Gm23130-201ENSMUST00000104252 74 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24277-201ENSMUST00000158661 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC125167.1-201ENSMUST00000198698 141 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm22884-201ENSMUST00000083127 140 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC0.59□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm24005-201ENSMUST00000158459 296 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 AC112972.1-201ENSMUST00000227329 365 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm25513-201ENSMUST00000083861 162 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm14296-202ENSMUST00000108931 750 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 2210418O10Rik-204ENSMUST00000166464 750 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm16405-201ENSMUST00000169247 468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm16404-201ENSMUST00000177739 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm14598-201ENSMUST00000180109 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Ccdc171E9Q1U1 Gm14625-201ENSMUST00000180231 468 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.8 ms