Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm25615-201ENSMUST00000177836 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 AC159709.1-201ENSMUST00000220445 349 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Mir181b-2-201ENSMUST00000083644 89 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm23230-201ENSMUST00000157298 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm37715-201ENSMUST00000193206 235 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Olfr375-ps1-201ENSMUST00000198131 249 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 CT954323.1-201ENSMUST00000222774 229 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.01
Gm3893E9Q1I1 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm32175-201ENSMUST00000193641 346 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm23219-201ENSMUST00000158123 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm23002-201ENSMUST00000179221 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25377-201ENSMUST00000104334 129 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm23109-201ENSMUST00000116867 126 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm11192-201ENSMUST00000127017 151 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25720-201ENSMUST00000157503 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm23892-201ENSMUST00000158105 130 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm7214-201ENSMUST00000222428 272 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir541-201ENSMUST00000102097 90 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Trgj3-201ENSMUST00000103562 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm15162-201ENSMUST00000119325 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm23536-201ENSMUST00000157541 134 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm37918-201ENSMUST00000192071 120 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm42774-201ENSMUST00000198854 283 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm24640-201ENSMUST00000116949 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm22626-201ENSMUST00000116990 126 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm22145-201ENSMUST00000157396 148 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm26431-201ENSMUST00000180199 127 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Mir3569-201ENSMUST00000185080 58 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm22097-201ENSMUST00000157929 278 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Gm45386-201ENSMUST00000210194 218 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
Gm3893E9Q1I1 Ighv3-1-201ENSMUST00000103478 350 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm3893E9Q1I1 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm3893E9Q1I1 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm3893E9Q1I1 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm3893E9Q1I1 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Gm3893E9Q1I1 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 149.8 ms