Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24937-201ENSMUST00000122597 134 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24440-201ENSMUST00000157236 63 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm25910-201ENSMUST00000157620 140 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24512-201ENSMUST00000174963 65 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm25935-201ENSMUST00000178746 107 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Scgb1b13-ps-201ENSMUST00000187330 273 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm44256-201ENSMUST00000203304 335 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm36189-201ENSMUST00000204113 523 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Olfr857-203ENSMUST00000217450 2271 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm6185-201ENSMUST00000193379 3553 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm23653-201ENSMUST00000116751 97 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm14652-201ENSMUST00000118479 235 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm22193-201ENSMUST00000116868 76 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm22281-201ENSMUST00000157198 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm25494-201ENSMUST00000158143 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Trav6-3-202ENSMUST00000183604 305 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm11351-202ENSMUST00000225724 478 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Ifi203-201ENSMUST00000042228 3754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 AC158982.2-201ENSMUST00000226283 184 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 AC127578.1-201ENSMUST00000227289 93 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm10722-201ENSMUST00000151376 651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm6060-201ENSMUST00000188671 251 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 AC154552.7-201ENSMUST00000222824 156 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm9174-201ENSMUST00000078149 255 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm32014-202ENSMUST00000215328 4168 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Apobec3Q99J72 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm25933-201ENSMUST00000178943 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm29406-201ENSMUST00000186400 235 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm22704-201ENSMUST00000083027 137 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Mir302d-201ENSMUST00000083513 66 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24896-201ENSMUST00000122741 135 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm24015-201ENSMUST00000157725 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Mir6405-201ENSMUST00000184584 124 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Apobec3Q99J72 Mir8090-201ENSMUST00000185078 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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