Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm37824-201ENSMUST00000193430 3236 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm26339-201ENSMUST00000102368 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm25901-201ENSMUST00000158494 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm25976-201ENSMUST00000158695 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Snora24-201ENSMUST00000174989 130 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm26968-201ENSMUST00000182894 481 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm44308-201ENSMUST00000197080 99 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm24038-201ENSMUST00000082872 159 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm26066-201ENSMUST00000083385 109 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm43877-201ENSMUST00000205029 2238 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Rpl30-ps5-201ENSMUST00000117104 361 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm11792-201ENSMUST00000120640 168 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm28414-201ENSMUST00000190111 294 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm37713-201ENSMUST00000191746 198 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm44358-201ENSMUST00000196301 98 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm25544-201ENSMUST00000122676 120 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm29022-201ENSMUST00000190702 225 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm25578-201ENSMUST00000083406 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Ccdc171E9Q1U1 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
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Ccdc171E9Q1U1 Gm26338-201ENSMUST00000102372 110 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22935-201ENSMUST00000103960 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm25650-201ENSMUST00000083784 162 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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Ccdc171E9Q1U1 Gm6377-201ENSMUST00000060013 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir695-201ENSMUST00000102261 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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Ccdc171E9Q1U1 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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Ccdc171E9Q1U1 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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Ccdc171E9Q1U1 Gm45658-201ENSMUST00000209197 580 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22302-201ENSMUST00000082657 106 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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Ccdc171E9Q1U1 Gm22279-201ENSMUST00000157200 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm38407-201ENSMUST00000218017 474 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm31447-201ENSMUST00000222345 384 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm21876-201ENSMUST00000096511 282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 AC127302.3-201ENSMUST00000215480 2791 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 n-R5s63-201ENSMUST00000122756 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
Ccdc171E9Q1U1 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC0.65□□□□□ -2.3
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