Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12770-201ENSMUST00000121734 462 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7953-201ENSMUST00000168278 469 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm27588-201ENSMUST00000185096 263 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm42622-201ENSMUST00000197229 355 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC130821.1-201ENSMUST00000221997 293 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Sval3-201ENSMUST00000080742 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12162-202ENSMUST00000129432 127 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25059-201ENSMUST00000157367 117 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm7925-201ENSMUST00000166690 401 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir28b-201ENSMUST00000175399 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18356-201ENSMUST00000185677 623 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22944-201ENSMUST00000158662 133 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23022-201ENSMUST00000158768 180 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir3109-201ENSMUST00000175301 88 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir6346-201ENSMUST00000183982 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr831-ps1-201ENSMUST00000086496 890 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm15010-201ENSMUST00000117153 407 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13324-201ENSMUST00000148607 569 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24480-201ENSMUST00000157442 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23557-201ENSMUST00000157820 138 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23641-201ENSMUST00000157857 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24726-201ENSMUST00000158232 121 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44482-201ENSMUST00000199232 103 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC164304.1-201ENSMUST00000226920 272 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC133079.1-201ENSMUST00000220943 1881 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 4921511C20Rik-201ENSMUST00000051530 1606 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps6-201ENSMUST00000119959 378 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14392-201ENSMUST00000120332 401 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14413-201ENSMUST00000122158 408 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24481-201ENSMUST00000157210 102 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22654-201ENSMUST00000157874 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25012-201ENSMUST00000158396 164 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22163-201ENSMUST00000158408 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm21905-201ENSMUST00000177616 87 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37361-201ENSMUST00000194345 132 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm42718-201ENSMUST00000197319 2681 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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