Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 AC167721.1-201ENSMUST00000217088 279 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Gm26456-201ENSMUST00000082831 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Vmn1r76-203ENSMUST00000226947 8145 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Gm14491-201ENSMUST00000121919 199 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22477-201ENSMUST00000122569 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Gm13479-201ENSMUST00000130773 4722 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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Rnft1Q9DCN7 Gm25632-201ENSMUST00000083112 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Mir186-201ENSMUST00000083497 71 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Gm23847-201ENSMUST00000083829 110 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Gm25253-201ENSMUST00000179958 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Gm28992-201ENSMUST00000190534 139 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Gm34139-201ENSMUST00000196166 294 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
Rnft1Q9DCN7 CT030645.1-201ENSMUST00000224020 231 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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