Protein–RNA interactions for Protein: P97789

Xrn1, 5'-3' exoribonuclease 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn1P97789 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrn1P97789 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrn1P97789 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms