Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Kif3aP28741 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Kif3aP28741 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms