Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trappc8E9PWG2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trappc8E9PWG2 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms