Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Brpf1B2RRD7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Brpf1B2RRD7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.4 ms