Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm24085-201ENSMUST00000175172 116 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Tmem167-ps2-201ENSMUST00000190251 214 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Smr2-203ENSMUST00000196477 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm18971-201ENSMUST00000197240 374 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Smr2-204ENSMUST00000199635 680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC167192.2-201ENSMUST00000224794 198 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC166830.2-201ENSMUST00000225821 196 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir10a-201ENSMUST00000083585 110 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14412-201ENSMUST00000108959 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23381-201ENSMUST00000157676 94 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm29397-201ENSMUST00000185205 333 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm34015-201ENSMUST00000194908 451 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44564-201ENSMUST00000207985 180 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC158606.1-201ENSMUST00000220078 325 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24431-201ENSMUST00000104073 66 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm12255-201ENSMUST00000117184 284 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11572-201ENSMUST00000119164 120 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11522-201ENSMUST00000120533 176 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir3086-201ENSMUST00000175072 87 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26501-201ENSMUST00000178307 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm27539-201ENSMUST00000184971 224 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37650-201ENSMUST00000193570 248 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC154515.1-201ENSMUST00000226085 2841 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13378-201ENSMUST00000117483 336 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25384-201ENSMUST00000157807 105 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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Col5a3Q9JLI2 Gm27226-201ENSMUST00000184676 511 ntTSL 2 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26265-201ENSMUST00000083277 135 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm14293-201ENSMUST00000118528 577 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm27236-201ENSMUST00000184147 442 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir195b-201ENSMUST00000184814 97 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 1700031L13Rik-204ENSMUST00000188072 812 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b1-ps-201ENSMUST00000189264 268 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23735-201ENSMUST00000082551 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC163660.3-201ENSMUST00000224253 1563 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23059-201ENSMUST00000158978 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm28343-201ENSMUST00000185386 112 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm37468-201ENSMUST00000194767 854 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 AC122242.1-201ENSMUST00000224650 304 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Col5a3Q9JLI2 Gm38388-201ENSMUST00000195569 1430 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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