Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir1298-201ENSMUST00000116681 98 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm13922-201ENSMUST00000119505 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22557-201ENSMUST00000157804 102 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 AC164086.1-201ENSMUST00000221038 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm31025-201ENSMUST00000222553 482 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm24616-201ENSMUST00000083274 139 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Il23r-201ENSMUST00000118364 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Slain1os-201ENSMUST00000160117 3101 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir669b-201ENSMUST00000102172 97 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22148-201ENSMUST00000104445 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm15861-201ENSMUST00000120979 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22330-201ENSMUST00000158068 115 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm24625-201ENSMUST00000082622 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm24929-201ENSMUST00000083403 139 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm8935-201ENSMUST00000066794 2798 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r19-201ENSMUST00000089830 2255 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm24601-201ENSMUST00000157970 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm21903-201ENSMUST00000178039 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm45430-201ENSMUST00000211276 260 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22248-201ENSMUST00000082482 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm24283-201ENSMUST00000104233 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22713-201ENSMUST00000116895 130 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm12143-201ENSMUST00000119666 332 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm24141-201ENSMUST00000122776 115 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm15961-201ENSMUST00000156090 266 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm27527-201ENSMUST00000183903 99 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm44399-201ENSMUST00000205043 226 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22421-201ENSMUST00000083058 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm25987-201ENSMUST00000083234 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm23320-201ENSMUST00000104462 127 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22553-201ENSMUST00000157797 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Mir7578-201ENSMUST00000183455 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm44964-201ENSMUST00000207011 273 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Rnft1Q9DCN7 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 213.9 ms