Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm24423-201ENSMUST00000101982 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s87-201ENSMUST00000122752 116 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm25664-201ENSMUST00000157697 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm26287-201ENSMUST00000158887 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm4746-201ENSMUST00000120395 2406 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm14846-201ENSMUST00000121868 216 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm24892-201ENSMUST00000122747 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm24436-201ENSMUST00000157889 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm25749-201ENSMUST00000175485 111 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm24388-201ENSMUST00000177872 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Mir465d-201ENSMUST00000196314 58 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm45859-201ENSMUST00000212794 214 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm10720-201ENSMUST00000099050 669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm23551-201ENSMUST00000116852 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm12304-201ENSMUST00000120312 385 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm23640-201ENSMUST00000157860 104 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm37746-201ENSMUST00000193249 198 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ssbp4Q3U4B1 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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Ssbp4Q3U4B1 Traj6-201ENSMUST00000103734 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm22784-201ENSMUST00000104088 132 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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Ssbp4Q3U4B1 Gm22433-201ENSMUST00000158550 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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Ssbp4Q3U4B1 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm44853-201ENSMUST00000209070 250 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 AC159885.1-201ENSMUST00000222221 199 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 AC125350.4-201ENSMUST00000225895 273 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 AC164297.1-201ENSMUST00000224484 1561 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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Ssbp4Q3U4B1 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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Ssbp4Q3U4B1 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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Ssbp4Q3U4B1 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm24761-201ENSMUST00000179589 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm22450-201ENSMUST00000179641 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm24488-201ENSMUST00000179934 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm25701-201ENSMUST00000179988 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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Ssbp4Q3U4B1 Ighv12-2-201ENSMUST00000191949 362 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 AC152979.2-201ENSMUST00000219702 3814 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ssbp4Q3U4B1 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
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