Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm14773-201ENSMUST00000125932 451 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm12434-201ENSMUST00000141580 653 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm23845-201ENSMUST00000083834 152 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm10542-201ENSMUST00000097586 273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm42536-201ENSMUST00000197562 1613 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Trdj2-201ENSMUST00000103683 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm24837-201ENSMUST00000158683 81 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Mir6406-201ENSMUST00000183592 120 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm27997-201ENSMUST00000184942 69 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm44909-201ENSMUST00000208756 165 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm13725-201ENSMUST00000122139 207 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm42594-201ENSMUST00000199511 246 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm23055-201ENSMUST00000082805 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Mir29c-201ENSMUST00000083614 88 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm15101-201ENSMUST00000178818 1502 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Olfr229-202ENSMUST00000214904 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm26077-201ENSMUST00000104064 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm22448-201ENSMUST00000179254 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 AC154552.1-201ENSMUST00000222969 202 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Rps24-ps2-201ENSMUST00000091375 395 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
H2-Q1O19441 AC102369.2-201ENSMUST00000219725 1679 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Olfr576-201ENSMUST00000098213 3132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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H2-Q1O19441 Gm13467-201ENSMUST00000145568 281 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23670-201ENSMUST00000157469 119 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22803-201ENSMUST00000158049 283 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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H2-Q1O19441 Mir1936-201ENSMUST00000158699 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Mir6997-201ENSMUST00000184313 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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H2-Q1O19441 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Hmgb1l-201ENSMUST00000082150 571 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm25402-201ENSMUST00000082966 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm22294-201ENSMUST00000083308 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Mir340-201ENSMUST00000083483 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm15215-201ENSMUST00000117773 489 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm13433-201ENSMUST00000121701 240 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm23324-201ENSMUST00000157421 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm20438-201ENSMUST00000174441 329 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm27540-201ENSMUST00000184950 187 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm18357-201ENSMUST00000188184 580 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm37377-201ENSMUST00000191733 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
H2-Q1O19441 Mir3535-201ENSMUST00000197651 147 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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