Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26127-201ENSMUST00000083193 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24456-201ENSMUST00000083198 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24018-201ENSMUST00000083232 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25794-201ENSMUST00000083286 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25577-201ENSMUST00000083414 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24861-201ENSMUST00000083459 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23103-201ENSMUST00000083725 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23732-201ENSMUST00000083751 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22352-201ENSMUST00000083917 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24448-201ENSMUST00000083979 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22886-201ENSMUST00000093714 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14774-201ENSMUST00000117857 536 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25885-201ENSMUST00000157779 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm27313-201ENSMUST00000183500 142 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC147560.1-201ENSMUST00000197528 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 1700030L22Rik-201ENSMUST00000221214 567 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC124772.1-201ENSMUST00000221325 151 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC114010.1-201ENSMUST00000222060 379 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr822-201ENSMUST00000080460 942 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr136-205ENSMUST00000216963 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps13-201ENSMUST00000120695 204 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24915-201ENSMUST00000157288 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25162-201ENSMUST00000158906 159 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25936-201ENSMUST00000179952 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir7667-201ENSMUST00000183866 63 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Defa-ps13-202ENSMUST00000212360 204 ntTSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44560-201ENSMUST00000207816 3115 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm36989-201ENSMUST00000193225 2160 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22689-201ENSMUST00000102452 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm15365-201ENSMUST00000122392 300 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm34411-201ENSMUST00000201180 280 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm35077-201ENSMUST00000204999 275 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC188459.1-201ENSMUST00000216651 300 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Defb41-201ENSMUST00000088463 467 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC160984.1-201ENSMUST00000225855 3154 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm6956-201ENSMUST00000134724 546 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23331-201ENSMUST00000157423 108 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26393-201ENSMUST00000157625 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22555-201ENSMUST00000157801 62 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44644-201ENSMUST00000207994 642 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC116589.1-201ENSMUST00000220634 327 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25079-201ENSMUST00000082529 203 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10360-201ENSMUST00000097219 272 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42635-201ENSMUST00000200266 2571 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm27396-201ENSMUST00000157708 58 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir466m-201ENSMUST00000175052 84 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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