Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Mir6993-201ENSMUST00000184912 65 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm15183-201ENSMUST00000118933 348 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm23168-201ENSMUST00000157156 143 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 AF357428-201ENSMUST00000083815 69 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr1369-ps1-202ENSMUST00000213326 3707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22051-201ENSMUST00000117002 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23716-201ENSMUST00000157348 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-78-201ENSMUST00000163670 294 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 AC124739.2-201ENSMUST00000222201 109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm25142-201ENSMUST00000082698 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Crem-231ENSMUST00000152108 654 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23325-201ENSMUST00000157422 129 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22967-201ENSMUST00000157956 239 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23895-201ENSMUST00000158108 160 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm42855-201ENSMUST00000197388 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 AC135292.1-201ENSMUST00000227665 204 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr104-ps-202ENSMUST00000215398 2771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r172-202ENSMUST00000173101 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm22956-201ENSMUST00000122520 80 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm25977-201ENSMUST00000158697 85 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm27793-201ENSMUST00000183405 76 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir6370-201ENSMUST00000183510 120 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm26265-202ENSMUST00000196326 133 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm44352-201ENSMUST00000196358 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm26135-201ENSMUST00000101993 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm24118-201ENSMUST00000103972 126 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm10959-201ENSMUST00000106431 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23667-201ENSMUST00000157466 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23409-201ENSMUST00000158516 237 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Snord50b-201ENSMUST00000178497 72 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm23297-201ENSMUST00000083184 127 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm25789-201ENSMUST00000083294 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Rnft1Q9DCN7 Gm45104-201ENSMUST00000208748 4350 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154.9 ms