Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Gm26249-201ENSMUST00000116708 118 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm25115-201ENSMUST00000157187 140 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm23120-201ENSMUST00000157654 287 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir669n-201ENSMUST00000158636 54 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm28717-201ENSMUST00000189950 315 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm22683-201ENSMUST00000082854 137 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir758-201ENSMUST00000103260 81 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 CT009696.2-201ENSMUST00000216668 432 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm13588-201ENSMUST00000120026 135 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm25113-201ENSMUST00000157185 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm23858-201ENSMUST00000158384 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm20613-201ENSMUST00000175828 345 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir6995-201ENSMUST00000183658 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir7017-201ENSMUST00000184894 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Ighv1-1-201ENSMUST00000194912 291 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm37404-201ENSMUST00000195726 359 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm44010-201ENSMUST00000204432 331 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 AC125488.1-201ENSMUST00000219586 212 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm24977-201ENSMUST00000083106 163 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm23345-201ENSMUST00000083817 150 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Vmn1r185-210ENSMUST00000228367 6982 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm22338-201ENSMUST00000157715 129 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm23043-201ENSMUST00000157890 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm28418-201ENSMUST00000186179 423 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm28995-201ENSMUST00000186625 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm22972-201ENSMUST00000083297 131 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 AC161250.2-201ENSMUST00000215114 3107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Cylc1-201ENSMUST00000101282 1923 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Olfr307-202ENSMUST00000213705 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir872-201ENSMUST00000104728 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm23983-201ENSMUST00000157142 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm25836-201ENSMUST00000158918 123 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm24333-201ENSMUST00000175101 84 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm24308-201ENSMUST00000177773 114 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm27640-201ENSMUST00000184580 147 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm29005-201ENSMUST00000186773 320 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Snord43-201ENSMUST00000199549 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 AC134601.3-201ENSMUST00000221682 154 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir133a-1-201ENSMUST00000083465 68 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PdgfraP26618 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm23010-201ENSMUST00000104151 126 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm14803-201ENSMUST00000117163 361 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm25781-201ENSMUST00000122527 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm22731-201ENSMUST00000158086 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm24799-201ENSMUST00000178431 79 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm28257-201ENSMUST00000185244 463 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Mir1291-201ENSMUST00000199842 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm43865-201ENSMUST00000204721 127 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 AC164161.1-201ENSMUST00000214076 639 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Olfr1108-ps1-201ENSMUST00000216930 121 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 AC155712.1-201ENSMUST00000219704 160 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 AC122834.1-201ENSMUST00000227182 425 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PdgfraP26618 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms