Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm37869-201ENSMUST00000193385 595 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm39473-201ENSMUST00000223498 522 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC108945.1-201ENSMUST00000226477 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC114916.1-201ENSMUST00000228465 494 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25853-201ENSMUST00000082793 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23097-201ENSMUST00000083448 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15088-201ENSMUST00000117973 1508 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15098-201ENSMUST00000119036 1508 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Mir223-201ENSMUST00000102112 110 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14551-201ENSMUST00000120802 256 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm11891-201ENSMUST00000121241 619 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24418-201ENSMUST00000177597 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22166-201ENSMUST00000178419 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24639-201ENSMUST00000178518 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23076-201ENSMUST00000179082 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25077-201ENSMUST00000179157 79 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23288-201ENSMUST00000179213 121 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm10193-201ENSMUST00000188288 231 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr849-201ENSMUST00000063923 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr872-201ENSMUST00000086474 1897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm10972-201ENSMUST00000107276 81 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC116589.9-201ENSMUST00000221462 908 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 CT030687.1-201ENSMUST00000221854 162 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Mir687-201ENSMUST00000102166 89 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22217-201ENSMUST00000157556 313 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23196-201ENSMUST00000158806 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25020-201ENSMUST00000178071 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Mir7j-201ENSMUST00000184427 122 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm27587-201ENSMUST00000185116 163 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm38261-201ENSMUST00000192608 316 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm7916-201ENSMUST00000120325 456 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24596-201ENSMUST00000122504 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24584-201ENSMUST00000157972 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25211-201ENSMUST00000177553 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25245-201ENSMUST00000178139 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26245-201ENSMUST00000178491 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23610-201ENSMUST00000178659 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Trav7d-4-201ENSMUST00000178768 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25101-201ENSMUST00000179057 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23712-201ENSMUST00000179713 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25173-201ENSMUST00000179794 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24870-201ENSMUST00000179897 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22645-201ENSMUST00000180010 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24565-201ENSMUST00000180099 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23805-201ENSMUST00000180129 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm25327-201ENSMUST00000180263 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22418-201ENSMUST00000180326 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC123062.1-201ENSMUST00000221287 481 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23629-201ENSMUST00000082465 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23924-201ENSMUST00000082474 108 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22749-201ENSMUST00000082490 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22747-201ENSMUST00000082495 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm22063-201ENSMUST00000082560 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm23057-201ENSMUST00000082801 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26328-201ENSMUST00000082821 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm26324-201ENSMUST00000083073 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Col5a3Q9JLI2 Gm24535-201ENSMUST00000083140 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms