Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Vmn2r74-201ENSMUST00000166355 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm25470-201ENSMUST00000175576 111 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm18617-201ENSMUST00000222311 259 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 AC165415.1-201ENSMUST00000228924 273 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Olfr59-204ENSMUST00000214048 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Olfr652-203ENSMUST00000216131 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm14215-201ENSMUST00000120578 221 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm11334-201ENSMUST00000121969 156 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm24054-201ENSMUST00000158619 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm25634-201ENSMUST00000082667 105 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Rag2-201ENSMUST00000044031 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RpainQ9CWY9 Gm43486-201ENSMUST00000196431 4339 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm22139-201ENSMUST00000158747 105 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm17067-202ENSMUST00000180131 123 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm42988-201ENSMUST00000198116 225 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 AC173115.1-201ENSMUST00000220835 211 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm13801-201ENSMUST00000120750 160 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm25457-201ENSMUST00000179509 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm24355-201ENSMUST00000082858 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm2869-201ENSMUST00000124359 2621 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm22003-201ENSMUST00000101885 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm23791-201ENSMUST00000122553 293 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm24138-201ENSMUST00000157572 114 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm22756-201ENSMUST00000180118 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm29308-201ENSMUST00000188863 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm28537-201ENSMUST00000189026 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm29631-201ENSMUST00000191065 315 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm44338-201ENSMUST00000198614 110 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm22970-201ENSMUST00000083304 186 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm24492-201ENSMUST00000083798 107 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Atp11c-205ENSMUST00000154051 6039 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 Gm43875-201ENSMUST00000203319 2475 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
RpainQ9CWY9 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
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