Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1099-202ENSMUST00000213456 4867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26384-201ENSMUST00000102183 110 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26089-201ENSMUST00000157898 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23355-201ENSMUST00000177614 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Mir6399-201ENSMUST00000184050 84 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21064-202ENSMUST00000190583 278 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Topbp1-ps2-201ENSMUST00000191289 189 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm42509-201ENSMUST00000197390 781 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24150-201ENSMUST00000082759 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23721-201ENSMUST00000083005 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 G2e3-203ENSMUST00000121521 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Mir1949-201ENSMUST00000157434 141 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25838-201ENSMUST00000158920 120 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23523-201ENSMUST00000180190 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23144-201ENSMUST00000180226 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC132954.1-201ENSMUST00000221017 342 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22443-201ENSMUST00000082890 107 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24262-201ENSMUST00000157431 144 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23100-201ENSMUST00000083455 141 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Snord87-201ENSMUST00000175437 87 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm37997-201ENSMUST00000193515 267 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 AC069561.2-201ENSMUST00000217596 420 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26102-201ENSMUST00000157251 284 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24997-201ENSMUST00000157910 105 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24846-201ENSMUST00000158033 108 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm18185-201ENSMUST00000186725 667 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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