Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm26022-201ENSMUST00000158663 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm20538-201ENSMUST00000166808 225 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Eif4e-206ENSMUST00000200239 526 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 AC131759.1-201ENSMUST00000220642 310 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm25895-201ENSMUST00000083714 100 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr1256-203ENSMUST00000213833 6081 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r83-202ENSMUST00000226701 2788 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm25272-201ENSMUST00000104293 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm25727-201ENSMUST00000104522 131 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm15714-201ENSMUST00000117168 250 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm13076-201ENSMUST00000118041 204 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm12276-201ENSMUST00000121709 301 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm25424-201ENSMUST00000157612 58 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm29167-201ENSMUST00000190024 377 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm45543-201ENSMUST00000209327 88 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm40604-202ENSMUST00000219541 522 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Mir184-201ENSMUST00000083662 69 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm42547-201ENSMUST00000201159 3798 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr1148-202ENSMUST00000215230 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 n-R5s31-201ENSMUST00000104162 110 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Tra2b-ps-201ENSMUST00000119906 168 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm13797-201ENSMUST00000121792 120 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm27698-201ENSMUST00000184060 249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm25930-201ENSMUST00000082785 107 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Rnft1Q9DCN7 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm15190-201ENSMUST00000120855 276 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm23183-201ENSMUST00000122595 323 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Rnft1Q9DCN7 Mir6408-201ENSMUST00000183643 91 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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Rnft1Q9DCN7 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
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Rnft1Q9DCN7 AC107757.3-201ENSMUST00000226312 535 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
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Rnft1Q9DCN7 Gm25814-201ENSMUST00000082754 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr476-202ENSMUST00000217173 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
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Rnft1Q9DCN7 Gm26293-201ENSMUST00000104170 84 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Rnft1Q9DCN7 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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Rnft1Q9DCN7 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
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Rnft1Q9DCN7 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 AC115735.1-201ENSMUST00000226633 350 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm24762-201ENSMUST00000083689 104 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Olfr1245-202ENSMUST00000217402 2610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Rnft1Q9DCN7 Gm27047-201ENSMUST00000183072 1819 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
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