Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm25643-201ENSMUST00000158874 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm25642-201ENSMUST00000175137 66 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm29242-201ENSMUST00000186570 457 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Serf1-201ENSMUST00000022145 601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr1317-201ENSMUST00000060098 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Lrrc19-202ENSMUST00000107101 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr1218-203ENSMUST00000215048 3900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm22752-201ENSMUST00000102083 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm14792-201ENSMUST00000119725 258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm16117-201ENSMUST00000160544 324 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 D730003K21Rik-201ENSMUST00000215052 589 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm45461-201ENSMUST00000211726 4535 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr339-202ENSMUST00000216645 4867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm11794-201ENSMUST00000119446 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm13569-201ENSMUST00000137221 574 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm23980-201ENSMUST00000157135 158 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm28849-201ENSMUST00000188127 174 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm28330-201ENSMUST00000190353 171 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Klk1b28-ps-201ENSMUST00000206374 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Tnfrsf23-203ENSMUST00000208017 544 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm37096-201ENSMUST00000192317 2058 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Nell1os-202ENSMUST00000136672 491 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm23589-201ENSMUST00000157660 105 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm22571-201ENSMUST00000082984 70 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Usp49Q6P9L4 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Usp49Q6P9L4 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Usp49Q6P9L4 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Usp49Q6P9L4 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Usp49Q6P9L4 Vmn1r29-203ENSMUST00000227761 4671 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Usp49Q6P9L4 Rny1-201ENSMUST00000083767 112 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Uty-201ENSMUST00000069309 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm37664-201ENSMUST00000194607 3813 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Pak3-210ENSMUST00000172330 8135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm5396-201ENSMUST00000121222 532 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm22192-201ENSMUST00000175128 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Usp49Q6P9L4 Gm7258-201ENSMUST00000179317 300 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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