Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28585-201ENSMUST00000187587 442 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir101a-201ENSMUST00000083517 83 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26327-201ENSMUST00000093724 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1013-202ENSMUST00000216397 4925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir450-2-201ENSMUST00000102444 69 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24582-201ENSMUST00000103967 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25507-201ENSMUST00000116981 144 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13804-201ENSMUST00000119552 172 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12823-201ENSMUST00000134494 318 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir1942-201ENSMUST00000157274 63 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24476-201ENSMUST00000157437 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24716-201ENSMUST00000157524 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26363-201ENSMUST00000158866 83 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24315-201ENSMUST00000177835 127 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC153541.1-201ENSMUST00000213786 294 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC112274.2-201ENSMUST00000218436 170 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22572-201ENSMUST00000082985 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm10717-202ENSMUST00000099042 669 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm4767-201ENSMUST00000099439 1497 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm43529-201ENSMUST00000199178 412 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC160031.2-201ENSMUST00000218242 274 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Clec4a4-201ENSMUST00000079379 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC124426.1-203ENSMUST00000221814 1362 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23586-201ENSMUST00000157657 123 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21737-201ENSMUST00000178112 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21729-201ENSMUST00000180058 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21853-201ENSMUST00000180071 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20901-201ENSMUST00000180177 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29495-201ENSMUST00000189319 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm28090-201ENSMUST00000189458 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21647-201ENSMUST00000189755 664 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24920-201ENSMUST00000083018 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Lipi-201ENSMUST00000062721 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm45886-201ENSMUST00000148141 342 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23752-201ENSMUST00000157584 115 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Col5a3Q9JLI2 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC1.02□□□□□ -2.25
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