Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Gm43680-201ENSMUST00000199466 340 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm45245-201ENSMUST00000210082 376 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr748-202ENSMUST00000213101 3632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm22883-201ENSMUST00000157376 106 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Mir1966-201ENSMUST00000158807 108 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm27893-201ENSMUST00000184408 194 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm37693-201ENSMUST00000194562 234 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AC151902.2-201ENSMUST00000226419 301 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Zfp934-202ENSMUST00000101547 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Mir1b-201ENSMUST00000117012 122 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm25269-201ENSMUST00000122601 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Vmn2r-ps78-201ENSMUST00000173350 308 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 H2al1k-201ENSMUST00000178196 510 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 CT485607.2-201ENSMUST00000214650 91 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AC160865.1-201ENSMUST00000219873 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AL590503.1-201ENSMUST00000222053 321 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm23736-201ENSMUST00000082553 75 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm24164-201ENSMUST00000093663 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm37515-201ENSMUST00000193321 3817 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr790-202ENSMUST00000203966 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm26097-201ENSMUST00000179642 93 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm27271-201ENSMUST00000183509 170 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Cr2-206ENSMUST00000193801 206 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 CT009748.1-201ENSMUST00000216068 269 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Gm24148-201ENSMUST00000082762 80 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r178-205ENSMUST00000227993 2518 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
Rnft1Q9DCN7 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm14748-201ENSMUST00000119819 411 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm14069-201ENSMUST00000120815 229 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm22606-201ENSMUST00000158290 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm24053-201ENSMUST00000158620 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 AC132615.1-201ENSMUST00000213873 255 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm22299-201ENSMUST00000082663 136 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm12449-201ENSMUST00000117572 234 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Rnft1Q9DCN7 Gm22384-201ENSMUST00000158187 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.4 ms