Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm25820-202ENSMUST00000197479 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm44085-201ENSMUST00000205056 372 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Snhg1-208ENSMUST00000206029 408 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC158597.1-201ENSMUST00000216234 150 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC151833.1-201ENSMUST00000227752 574 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm23412-201ENSMUST00000083017 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Nkain2-202ENSMUST00000092603 273 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm1980-201ENSMUST00000123131 2306 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 9230113P08Rik-201ENSMUST00000176049 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm45178-201ENSMUST00000207744 4110 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Trbv17-201ENSMUST00000103275 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Ighv9-3-201ENSMUST00000103473 351 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm25529-201ENSMUST00000104850 92 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm13880-201ENSMUST00000118421 474 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm22263-201ENSMUST00000180060 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm27753-201ENSMUST00000184742 203 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm37338-201ENSMUST00000191986 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr1181-203ENSMUST00000213190 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Skint6-202ENSMUST00000171224 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm23011-201ENSMUST00000104148 132 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm9059-201ENSMUST00000118319 183 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm10772-201ENSMUST00000167981 255 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Gm28579-201ENSMUST00000186143 369 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm22678-201ENSMUST00000116974 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Gm22062-201ENSMUST00000082563 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Gm13885-201ENSMUST00000117569 187 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Trav6d-3-202ENSMUST00000184883 308 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Gm42439-201ENSMUST00000195931 486 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Igkv13-55-1-201ENSMUST00000200400 308 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm44429-201ENSMUST00000203542 186 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC123709.1-201ENSMUST00000224848 345 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr152-201ENSMUST00000090709 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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H2-Q1O19441 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Vmn1r86-201ENSMUST00000094828 951 ntAPPRIS P2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Olfr394-202ENSMUST00000214284 5562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm43540-201ENSMUST00000196320 3848 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
H2-Q1O19441 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
H2-Q1O19441 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
H2-Q1O19441 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
H2-Q1O19441 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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