Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm17332-201ENSMUST00000165626 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps150-201ENSMUST00000176659 736 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42475-201ENSMUST00000201212 295 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18703-201ENSMUST00000215318 333 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC124569.4-201ENSMUST00000223830 1220 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 CT485608.2-201ENSMUST00000227210 291 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1154-202ENSMUST00000215017 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22779-201ENSMUST00000104085 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26474-201ENSMUST00000116762 122 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Atp5k-ps2-201ENSMUST00000120437 210 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6182-201ENSMUST00000156439 1208 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26157-201ENSMUST00000158974 126 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 BC050972-201ENSMUST00000168475 526 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC120383.1-201ENSMUST00000221123 573 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm34408-201ENSMUST00000222104 655 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 BC100530-201ENSMUST00000096089 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25876-201ENSMUST00000104329 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15211-201ENSMUST00000118932 528 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13720-201ENSMUST00000120741 196 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13903-201ENSMUST00000120945 193 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm13368-201ENSMUST00000122443 430 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Esp16-201ENSMUST00000178037 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir6380-201ENSMUST00000184334 81 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm20837-202ENSMUST00000190558 844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9236-201ENSMUST00000196892 587 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Mir27b-201ENSMUST00000083541 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23705-201ENSMUST00000104370 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24323-201ENSMUST00000175342 77 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm37727-201ENSMUST00000191637 819 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm17906-201ENSMUST00000202480 901 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm44446-201ENSMUST00000204864 255 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr1430-ps1-201ENSMUST00000207422 917 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22229-201ENSMUST00000082987 108 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm6358-201ENSMUST00000089101 156 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 AC134917.1-201ENSMUST00000220517 1449 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm12417-201ENSMUST00000119153 403 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15266-201ENSMUST00000119635 255 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25335-201ENSMUST00000158043 103 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm22382-201ENSMUST00000158185 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm24056-201ENSMUST00000158617 146 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm16577-201ENSMUST00000161579 471 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25994-201ENSMUST00000175392 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Col5a3Q9JLI2 Gm25730-201ENSMUST00000178753 165 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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