Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm44655-201ENSMUST00000207768 423 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm19441-201ENSMUST00000221545 330 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 CT009718.4-201ENSMUST00000221881 109 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Snora3-201ENSMUST00000083082 132 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Snora34-201ENSMUST00000083402 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm37602-201ENSMUST00000195187 3310 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm6829-201ENSMUST00000119858 360 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm25543-201ENSMUST00000122678 312 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm22075-201ENSMUST00000158599 192 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm25035-201ENSMUST00000175414 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm21738-201ENSMUST00000177817 681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm21094-201ENSMUST00000177842 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm20837-201ENSMUST00000178446 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm21739-201ENSMUST00000178639 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm28891-201ENSMUST00000178751 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm28490-201ENSMUST00000179076 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm21861-201ENSMUST00000179480 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm21256-201ENSMUST00000179672 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm20838-201ENSMUST00000179884 498 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm21679-201ENSMUST00000180373 498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm5269-201ENSMUST00000183590 138 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Mir6388-201ENSMUST00000184417 75 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm38395-201ENSMUST00000199904 830 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm44844-201ENSMUST00000207242 336 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 AC122428.1-201ENSMUST00000213709 217 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 AC120394.1-201ENSMUST00000217153 351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Olfr1450-202ENSMUST00000213587 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm22497-201ENSMUST00000104499 131 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm24598-201ENSMUST00000122510 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm25914-201ENSMUST00000157618 153 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm23854-201ENSMUST00000158378 108 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm26405-201ENSMUST00000158495 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Mir9-3-201ENSMUST00000175497 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Obox4-ps34-201ENSMUST00000175879 520 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gtpbp4-ps1-201ENSMUST00000184732 249 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm19901-201ENSMUST00000192191 495 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm45315-201ENSMUST00000209283 333 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 AC167669.4-201ENSMUST00000225967 140 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Mir221-201ENSMUST00000083488 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm23731-201ENSMUST00000083749 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm37061-201ENSMUST00000195066 3243 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm23015-201ENSMUST00000104145 128 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm25421-201ENSMUST00000104218 164 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm11606-201ENSMUST00000120706 617 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm22559-201ENSMUST00000157329 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm23181-201ENSMUST00000158685 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Igkv17-134-201ENSMUST00000168310 348 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 B230207O21Rik-201ENSMUST00000198634 321 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Olfr185-ps1-201ENSMUST00000205894 881 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm45907-201ENSMUST00000213023 193 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm25357-201ENSMUST00000082745 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Trappc1Q5NCF2 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trappc1Q5NCF2 Gm24865-201ENSMUST00000103246 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trappc1Q5NCF2 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trappc1Q5NCF2 Gm24282-201ENSMUST00000104232 66 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trappc1Q5NCF2 Gm10778-201ENSMUST00000105315 1497 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Trappc1Q5NCF2 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Trappc1Q5NCF2 Gm13475-201ENSMUST00000119290 234 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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